Das Schneiden von Glasbausteinen ist nur mit viel Mühe möglich. Die Gläser herkömmlicher Größe sollten mit einer Glastrennscheibe geschnitten werden, wobei schiefe und gesplitterte Schnittkanten entstehen werden. Für sehr dünne Glasbausteine ist die Möglichkeit des Ritzens mit dem Glasschneider gegeben.
Es ist schwer möglich, Glasbausteine in eine passende Größe zu schneiden. Die einzige Möglichkeit für Bausteine herkömmlicher Größe ist die Bearbeitung mit der Glastrennscheibe. Hierbei handelt es sich um eine besonders widerstandsfähige Trennscheibe für den Winkelschleifer. Auch für die Handkreissäge existiert eine entsprechende Trennscheibe. Da die Trennscheibe sehr schnell rotiert, sind Absplitterungen einzuplanen, die eine Nacharbeit notwendig machen.
Haben die Bausteine eine Sondergröße und sind besonders dünn, so kann es unter Umständen gelingen, einen herkömmlichen Glasschneider zum Schneiden zu nutzen. Hierbei wird mit der Methode Ritzen und Brechen gearbeitet. Dies bedeutet, dass die Steine mit der Klinge vom Glasschneider eingeritzt werden. Im Anschluss folgt das Brechen, indem die Bruchstelle genau über eine Kante gelegt und heruntergedrückt wird.
Damit die Glasbausteine beim Mauern eine schöne Optik bilden, sollten diese geschliffen und poliert werden. Schnittstellen sollten zunächst immer mit einem gröberen Korn geschliffen werden. Anschließend ist das Polieren der nächste Schritt, welches mit einer deutlich feineren Körnung erfolgt. Dabei sollten das Glas und die Poliermaschine jederzeit mit Wasser gekühlt werden. Ansonsten würde das Glas zu heiß und sich verfärben.